Gene name

Muc16 (CA125)

Experiment(s)

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For ortholog entries:
A0A140LJ72_MOUSE
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Alignment and sequence features

Wheel: zoom in/out; drag: scroll left/right. Sequences and features are drawn in three lines. Bottom line: topology (red bar: cytoplasmic region; yellow bar: transmembrane region; transmembrane re-entrant loop; blue bar: extracellular region; black bar: signal peptide). Middle line: amino acid sequence (grey bar or one letter code). Top line: post translational modifications (Y: N-glycosylation site; Y: O-glycosylation site;P: phosphorylation site), intrinsically disordered regions (light green bar: IDR) and short linear motifs (light steel blue bar: ELM region).
CCTOP topology prediction
Start End Localisation
1 14451 Extracellular
14452 14475 Membrane
14476 14507 Cytoplasmic
Phosphorylation
Position Resource
27 25280604
35 34366650
54 25280660
63 23258064
66 23258066
68 23258068
69 23258070
70 23258072
84 25280538
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97 25308974
124 34551200
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178 23258078
202 23258080
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12795 18012520
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13952 25310001
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14067 23258308
14068 23258310
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14487 12427208
14497 12427664
14499 15404674
Glycosylation
Position Site resource Glycan resource PubMed link(s)
139 N-GlycoSiteAtlas
241 O-GlycoProteomDB
245 O-GlycoProteomDB
248 O-GlycoProteomDB
296 O-GlycoProteomDB
363 O-GlycoProteomDB
366 O-GlycoProteomDB
373 O-GlycoProteomDB
378 O-GlycoProteomDB
379 O-GlycoProteomDB
384 O-GlycoProteomDB
472 PhosphoSitePlus WURCS=2.0/1,1,0/[a2112h-1x_1-5_2*NCC/3=O]/1/
472 dbPTM 55824907
475 PhosphoSitePlus WURCS=2.0/1,1,0/[a2112h-1x_1-5_2*NCC/3=O]/1/
475 dbPTM 50617841
477 PhosphoSitePlus WURCS=2.0/1,1,0/[a2112h-1x_1-5_2*NCC/3=O]/1/
477 dbPTM 55824915
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480 dbPTM 55824919
520 O-GlycoProteomDB
521 O-GlycoProteomDB
523 O-GlycoProteomDB
524 O-GlycoProteomDB
529 O-GlycoProteomDB
534 O-GlycoProteomDB
594 O-GlycoProteomDB
595 O-GlycoProteomDB
599 O-GlycoProteomDB
600 O-GlycoProteomDB
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620 O-GlycoProteomDB
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623 O-GlycoProteomDB
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624 O-GlycoProteomDB
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628 O-GlycoProteomDB
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634 O-GlycoProteomDB
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695 O-GlycoProteomDB
699 O-GlycoProteomDB
703 O-GlycoProteomDB
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708 O-GlycoProteomDB
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709 O-GlycoProteomDB
714 O-GlycoProteomDB
718 PhosphoSitePlus WURCS=2.0/1,1,0/[a2112h-1x_1-5_2*NCC/3=O]/1/
718 dbPTM 50617833
718 O-GlycoProteomDB
721 O-GlycoProteomDB
723 O-GlycoProteomDB
793 O-GlycoProteomDB
796 O-GlycoProteomDB
798 O-GlycoProteomDB
805 O-GlycoProteomDB
844 O-GlycoProteomDB
848 O-GlycoProteomDB
854 O-GlycoProteomDB
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