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Gene name

CTSD (CPSD)

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Alignment and sequence features

Wheel: zoom in/out; drag: scroll left/right. Sequences and features are drawn in three lines. Bottom line: topology (red bar: cytoplasmic region; yellow bar: transmembrane region; transmembrane re-entrant loop; blue bar: extracellular region; black bar: signal peptide). Middle line: amino acid sequence (grey bar or one letter code). Top line: post translational modifications (Y: N-glycosylation site; Y: O-glycosylation site;P: phosphorylation site), intrinsically disordered regions (light green bar: IDR) and short linear motifs (light steel blue bar: ELM region).

CCTOP topology prediction

Start	End	Localisation
1	410	Extracellular

Phosphorylation

Position	Resource
42	25735203
228	14572043
230	14572046
248	14572049
250	14572052

Glycosylation

Position	Site resource	Glycan resource	PubMed link(s)
134	Glyconnect	$WURCS=2.0/2,7,6/[axxxxh-1x_1-5_2*NCC/3=O][axxxxh-1x_1-5]/1-1-2-2-2-2-2/a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?$	30899004
134	PDB		8393577
134	Glyconnect	$WURCS=2.0/2,8,7/[axxxxh-1x_1-5_2*NCC/3=O][axxxxh-1x_1-5]/1-1-2-2-2-2-2-2/a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?$	30899004
134	PDB		32003991
134	PDB		32003991
134	PDB		32003991
134	UniProtKB
134	Glyconnect	$WURCS=2.0/2,9,8/[axxxxh-1x_1-5_2*NCC/3=O][axxxxh-1x_1-5]/1-1-2-2-2-2-2-2-2/a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?$	30899004
261	UniProtKB		16170054
261	UniCarbKB		16170054
261	dbPTM		16170054
261	Glyconnect	$WURCS=2.0/2,8,8/[axxxxh-1x_1-5_2NCC/3=O][axxxxh-1x_1-5]/1-1-2-2-2-2-2-2/a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}OPO/3O/3=O_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?$	30899004
261	Glyconnect	$WURCS=2.0/3,10,9/[axxxxm-1x_1-5][axxxxh-1x_1-5_2*NCC/3=O][axxxxh-1x_1-5]/1-2-2-2-3-3-3-3-3-3/a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?\|j?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?\|j?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?\|j?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?\|j?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?\|j?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?\|j?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?\|j?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?\|j?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?\|j?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?\|j?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?\|j?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?\|j?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?\|j?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?\|j?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?\|j?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?\|j?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?\|j?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?\|j?$	30899004
261	Glyconnect	$WURCS=2.0/3,6,5/[axxxxm-1x_1-5][axxxxh-1x_1-5_2*NCC/3=O][axxxxh-1x_1-5]/1-2-2-3-3-3/a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?$	30899004
261	Glyconnect	$WURCS=2.0/2,6,5/[axxxxh-1x_1-5_2*NCC/3=O][axxxxh-1x_1-5]/1-1-2-2-2-2/a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?$	30899004
261	Glyconnect	$WURCS=2.0/2,8,7/[axxxxh-1x_1-5_2*NCC/3=O][axxxxh-1x_1-5]/1-1-2-2-2-2-2-2/a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?$	30899004
261	Glyconnect	$WURCS=2.0/3,8,7/[axxxxm-1x_1-5][axxxxh-1x_1-5_2*NCC/3=O][axxxxh-1x_1-5]/1-2-2-3-3-3-3-3/a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?$	30899004
261	Glyconnect	$WURCS=2.0/4,9,8/[Aad21122h-2x_2-6_5NCC/3=O][axxxxm-1x_1-5][axxxxh-1x_1-5_2NCC/3=O][axxxxh-1x_1-5]/1-2-3-3-3-4-4-4-4/a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?$	30899004
261	Glyconnect	$WURCS=2.0/2,7,6/[axxxxh-1x_1-5_2*NCC/3=O][axxxxh-1x_1-5]/1-1-2-2-2-2-2/a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?$	30899004
261	Glyconnect	$WURCS=2.0/2,9,8/[axxxxh-1x_1-5_2*NCC/3=O][axxxxh-1x_1-5]/1-1-2-2-2-2-2-2-2/a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?\|h?\|i?$	30899004
261	Glyconnect	$WURCS=2.0/3,7,6/[axxxxm-1x_1-5][axxxxh-1x_1-5_2*NCC/3=O][axxxxh-1x_1-5]/1-2-2-3-3-3-3/a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?_a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?}-{a?\|b?\|c?\|d?\|e?\|f?\|g?$	30899004

Family and domain data

Database	Domain/Family name
InterPro	Aspartic_peptidase_A1
InterPro	Aspartic_peptidase_AS
InterPro	Aspartic_peptidase_N
InterPro	Cathepsin_D
InterPro	PEPTIDASE_A1
InterPro	Peptidase_aspartic_dom_sf
Pfam	A1_Propeptide
Pfam	Asp

Interactions

With (links to EBI)	#Exp	PubMed links
MPRI_MOUSE	2	20541250

Protein can be found in apical membrane, Protein can be found in basal membrane, Protein can be found both membranes, Localisation is unknown.